74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2086 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  100 
 
 
262 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1017  LmbE-like protein  35.71 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1075  LmbE family protein  35.54 
 
 
258 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1078  LmbE family protein  35.25 
 
 
258 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0142184  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2689  LmbE-like protein  31.4 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7836  LmbE family protein  31.56 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0441  LmbE family protein  30.83 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2069  LmbE family protein  30.08 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.512905  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  29.93 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1639  mycothiol conjugate amidase Mca  30.6 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  29.93 
 
 
220 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  29.5 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.77 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  32.41 
 
 
447 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  31.33 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  28.48 
 
 
207 aa  52.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  30.53 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  27.39 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  30.88 
 
 
239 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  30.87 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  24.1 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  33.81 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  26.01 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.07 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  22.69 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  30.66 
 
 
238 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  30.99 
 
 
290 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  23.27 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  29.3 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  32.61 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  27.54 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  27.14 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  32.5 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  27.96 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  26.14 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  31.39 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  29.2 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  33.81 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  27.1 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  25.53 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  29.79 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  32.26 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1066  mycothiol conjugate amidase Mca  30.99 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  27.54 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  30.88 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4417  mycothiol conjugate amidase Mca  30 
 
 
359 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.72 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  24.5 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  27.46 
 
 
229 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1891  mycothiol conjugate amidase Mca  30.56 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  27.45 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  25.76 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  26.36 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08230  mycothiol conjugate amidase Mca  31.21 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0513099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  32.5 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  24.75 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  24 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  25.87 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  28.77 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.4 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  33.06 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0724  mycothiol conjugate amidase Mca  26.8 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.779113  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  26.92 
 
 
221 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  26.92 
 
 
221 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.06 
 
 
228 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>