15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5737 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  89.43 
 
 		 472 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  939    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  67.45 
 
 		 469 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  66.38 
 
 		 478 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  67.17 
 
 		 485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  64.45 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  64.45 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  64.03 
 
 		 467 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  63.38 
 
 		 476 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  58.99 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  59.57 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0845  LmbE family protein  31.03 
 
 		 445 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  30.6 
 
 		 322 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  27.17 
 
 		 237 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3554  LmbE family protein  24.66 
 
 		 337 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>