14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  938    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  89.43 
 
 
473 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  66.31 
 
 
478 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  67.6 
 
 
469 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  66.02 
 
 
485 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  66.09 
 
 
467 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  65.67 
 
 
467 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  65.88 
 
 
467 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  65.24 
 
 
476 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  57.63 
 
 
487 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  59.83 
 
 
462 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0845  LmbE family protein  31.46 
 
 
445 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  31.58 
 
 
322 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
817 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>