200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4142 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.77 
 
 		 647 aa  796    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1285  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  48.75 
 
 		 655 aa  640    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  100 
 
 		 639 aa  1330    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  49.84 
 
 		 655 aa  636    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  54.94 
 
 		 641 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.47 
 
 		 637 aa  782    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  58.93 
 
 		 637 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.9 
 
 		 642 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.21 
 
 		 670 aa  806    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.69 
 
 		 642 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  56.85 
 
 		 657 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  59.08 
 
 		 646 aa  796    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.35 
 
 		 642 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  57.09 
 
 		 303 aa  289  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.77 
 
 		 242 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.32 
 
 		 242 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.37 
 
 		 268 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.93 
 
 		 256 aa  208  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.72 
 
 		 241 aa  207  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.61 
 
 		 264 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.06 
 
 		 263 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 251 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.69 
 
 		 253 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 256 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.05 
 
 		 279 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.92 
 
 		 268 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.63 
 
 		 260 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.28 
 
 		 249 aa  194  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.35 
 
 		 262 aa  193  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.45 
 
 		 253 aa  193  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 242 aa  191  4e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.29 
 
 		 266 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.79 
 
 		 250 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 259 aa  186  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 252 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  43.23 
 
 		 260 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.83 
 
 		 260 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.7 
 
 		 245 aa  184  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.93 
 
 		 265 aa  180  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.33 
 
 		 242 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.33 
 
 		 261 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.81 
 
 		 236 aa  177  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.32 
 
 		 268 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.64 
 
 		 261 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.92 
 
 		 260 aa  173  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.05 
 
 		 262 aa  170  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.05 
 
 		 262 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.41 
 
 		 260 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.74 
 
 		 262 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.06 
 
 		 270 aa  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.32 
 
 		 271 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.61 
 
 		 262 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.92 
 
 		 261 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.18 
 
 		 277 aa  164  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.3 
 
 		 259 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.87 
 
 		 266 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.32 
 
 		 247 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.79 
 
 		 244 aa  162  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.73 
 
 		 262 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.34 
 
 		 270 aa  161  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.87 
 
 		 266 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.38 
 
 		 266 aa  160  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.5 
 
 		 262 aa  160  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.18 
 
 		 263 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.87 
 
 		 266 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.13 
 
 		 261 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.35 
 
 		 266 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.87 
 
 		 266 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  39.13 
 
 		 339 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 243 aa  158  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.71 
 
 		 246 aa  158  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.87 
 
 		 266 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.87 
 
 		 266 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.56 
 
 		 260 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.3 
 
 		 240 aa  157  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.48 
 
 		 255 aa  156  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 235 aa  156  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 233 aa  156  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.38 
 
 		 266 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.38 
 
 		 266 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.38 
 
 		 266 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.38 
 
 		 266 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  42.66 
 
 		 234 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.38 
 
 		 266 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  39.18 
 
 		 253 aa  154  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.42 
 
 		 266 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  37.45 
 
 		 358 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.42 
 
 		 266 aa  154  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.68 
 
 		 252 aa  153  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  40.68 
 
 		 252 aa  153  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.72 
 
 		 276 aa  153  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.19 
 
 		 266 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.9 
 
 		 266 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.9 
 
 		 266 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>