202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0215 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  67.5 
 
 
252 aa  345  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  67.5 
 
 
252 aa  345  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.9 
 
 
251 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.06 
 
 
253 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.88 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.78 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.32 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.98 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.1 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.75 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.55 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.68 
 
 
242 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.24 
 
 
262 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.47 
 
 
253 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.35 
 
 
262 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.35 
 
 
262 aa  207  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 
262 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.96 
 
 
241 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  49.76 
 
 
262 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.27 
 
 
249 aa  202  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  52.4 
 
 
234 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.88 
 
 
233 aa  201  9e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.97 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.98 
 
 
240 aa  195  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.66 
 
 
256 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.15 
 
 
242 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.2 
 
 
256 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.68 
 
 
242 aa  187  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.55 
 
 
244 aa  183  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.61 
 
 
265 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.27 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  37.66 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.49 
 
 
264 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.6 
 
 
266 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.66 
 
 
268 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.77 
 
 
261 aa  165  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.24 
 
 
263 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.89 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.86 
 
 
637 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.98 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.24 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.19 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.01 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.98 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  39.35 
 
 
262 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  41.22 
 
 
253 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.83 
 
 
261 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.43 
 
 
641 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.83 
 
 
260 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.61 
 
 
260 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.86 
 
 
639 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.89 
 
 
270 aa  158  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.68 
 
 
260 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.9 
 
 
259 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  40.09 
 
 
647 aa  155  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  40 
 
 
642 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 
279 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.1 
 
 
266 aa  154  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  35.77 
 
 
339 aa  153  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.98 
 
 
268 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.68 
 
 
642 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.29 
 
 
277 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.89 
 
 
259 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.14 
 
 
657 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.75 
 
 
247 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.46 
 
 
655 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  36.44 
 
 
670 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.84 
 
 
646 aa  148  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  35.78 
 
 
255 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.84 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05361  6-phosphogluconolactonase/glucosamine-6- phosphate isomerase/deaminase  37.67 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.94 
 
 
268 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.19 
 
 
637 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.5 
 
 
270 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.74 
 
 
246 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  34.84 
 
 
358 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62706  Glucosamine-6-phosphate isomerase (Glucosamine-6-phosphate deaminase) (GNPDA) (GlcN6P deaminase)  35.63 
 
 
252 aa  141  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.92 
 
 
303 aa  141  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.69 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.55 
 
 
642 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.23 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.75 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.23 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  32.74 
 
 
240 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.06 
 
 
266 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.41 
 
 
268 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.82 
 
 
266 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>