224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1026 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 234 aa  476  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  57.51 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  58.37 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  54.51 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.71 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  52.79 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  50 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  49.57 
 
 		 262 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.07 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.07 
 
 		 262 aa  235  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.93 
 
 		 262 aa  234  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.7 
 
 		 253 aa  207  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  46.06 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.23 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  46.47 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.64 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.87 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.92 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.06 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.84 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.39 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.57 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.21 
 
 		 268 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.04 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.92 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.8 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  41.08 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.98 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.42 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.6 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  41.46 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.24 
 
 		 637 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.84 
 
 		 642 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  39.33 
 
 		 253 aa  165  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.5 
 
 		 270 aa  165  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.7 
 
 		 641 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.11 
 
 		 266 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.55 
 
 		 670 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.98 
 
 		 261 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.02 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.13 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.65 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.62 
 
 		 260 aa  158  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.98 
 
 		 261 aa  158  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.99 
 
 		 647 aa  158  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.72 
 
 		 646 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.04 
 
 		 279 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.37 
 
 		 642 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  44.86 
 
 		 637 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.65 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.85 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.66 
 
 		 639 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.7 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  43.38 
 
 		 642 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  36.82 
 
 		 655 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.66 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.93 
 
 		 657 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.21 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.38 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.41 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.45 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.39 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.74 
 
 		 263 aa  141  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.01 
 
 		 276 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.89 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62706  Glucosamine-6-phosphate isomerase (Glucosamine-6-phosphate deaminase) (GNPDA) (GlcN6P deaminase)  40.28 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.42 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2142  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.89 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1200  Glucosamine-6-phosphate deaminase  31.95 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.96 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.96 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.96 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.96 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.96 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  34.91 
 
 		 339 aa  124  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.43 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.8 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2098  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.49 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.55 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.49 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5244  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.965081 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.02 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.43 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>