228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0943 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 264 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  88.12 
 
 		 263 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  87.36 
 
 		 262 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  83.21 
 
 		 268 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  54.26 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.88 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.46 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  49.8 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  52.78 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.79 
 
 		 256 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.35 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  49.38 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.96 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.79 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  49 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.03 
 
 		 268 aa  244  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.98 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.2 
 
 		 259 aa  242  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.5 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.56 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.38 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  49 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.94 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  48.45 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.86 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.04 
 
 		 263 aa  231  9e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.58 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.88 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.95 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.04 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.56 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  49.79 
 
 		 655 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  45.19 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.28 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.89 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.98 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.71 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  46.94 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.56 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.18 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.03 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.42 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.42 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.42 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.73 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.42 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.9 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.73 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.35 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.6 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.48 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.89 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  44.67 
 
 		 670 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  40.89 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.01 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.27 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  45.71 
 
 		 647 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.34 
 
 		 642 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  47.88 
 
 		 637 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  44.49 
 
 		 642 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.22 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.11 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  45.61 
 
 		 639 aa  205  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.57 
 
 		 657 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  45.31 
 
 		 637 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  42.51 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  44 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  48.31 
 
 		 641 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.98 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.85 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.32 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  194  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.55 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.21 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.75 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  47.79 
 
 		 646 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>