235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0180 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  77.63 
 
 
255 aa  341  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  55.23 
 
 
260 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  55.33 
 
 
259 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  52.7 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.78 
 
 
260 aa  234  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  52.1 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.54 
 
 
260 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  50.2 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.77 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4483  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.23 
 
 
261 aa  214  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.543122  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.58 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  47.11 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  49.59 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.59 
 
 
256 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  47.3 
 
 
260 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.06 
 
 
256 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.55 
 
 
268 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.67 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
242 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
242 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.98 
 
 
268 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.83 
 
 
264 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.66 
 
 
241 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.26 
 
 
263 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.83 
 
 
262 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.25 
 
 
262 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.17 
 
 
262 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.8 
 
 
253 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.42 
 
 
262 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.42 
 
 
251 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.98 
 
 
250 aa  186  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.56 
 
 
249 aa  185  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.25 
 
 
242 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.74 
 
 
236 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.17 
 
 
244 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.11 
 
 
253 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.56 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.1 
 
 
670 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.67 
 
 
245 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.45 
 
 
303 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.5 
 
 
642 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.77 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.16 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.08 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.82 
 
 
235 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.67 
 
 
279 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.91 
 
 
266 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.38 
 
 
233 aa  168  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.6 
 
 
233 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 
252 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  41.46 
 
 
234 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  42.65 
 
 
339 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.76 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.62 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  39.15 
 
 
641 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.82 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.06 
 
 
263 aa  161  9e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  38.5 
 
 
639 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.93 
 
 
266 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.71 
 
 
247 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.12 
 
 
637 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.67 
 
 
270 aa  158  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.21 
 
 
252 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  38.21 
 
 
252 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.33 
 
 
647 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  39.24 
 
 
240 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.06 
 
 
266 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.33 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1103  glucosamine-6-phosphate isomerase 2  45.75 
 
 
243 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.265713 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  39 
 
 
358 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  40 
 
 
642 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1549  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.13 
 
 
271 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000670802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.7 
 
 
646 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.83 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.83 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.83 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.83 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.83 
 
 
266 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  37.08 
 
 
637 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.96 
 
 
268 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.25 
 
 
266 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.47 
 
 
266 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.03 
 
 
240 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00635  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0573  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0769  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136799  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0703  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00284745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2978  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>