232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2744 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  98.76 
 
 
242 aa  487  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  60.17 
 
 
253 aa  300  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  55.19 
 
 
241 aa  292  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  53.22 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.41 
 
 
242 aa  269  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.62 
 
 
249 aa  268  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.79 
 
 
251 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.21 
 
 
250 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  51.87 
 
 
244 aa  263  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.16 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.95 
 
 
256 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.96 
 
 
253 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  49.79 
 
 
242 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.55 
 
 
268 aa  250  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.96 
 
 
264 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.72 
 
 
263 aa  245  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.21 
 
 
233 aa  237  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
262 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  50.62 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  46.25 
 
 
240 aa  228  9e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.03 
 
 
268 aa  227  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.64 
 
 
262 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.72 
 
 
233 aa  221  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.5 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2313  Glucosamine-6-phosphate deaminase  48.54 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0207649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  45.23 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.3 
 
 
233 aa  218  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.44 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.72 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13500  glucosamine-6-phosphate isomerase  48.53 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  47.66 
 
 
641 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.67 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.32 
 
 
279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.21 
 
 
642 aa  215  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.4 
 
 
262 aa  214  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.98 
 
 
670 aa  214  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  47.39 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.15 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  44.4 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.1 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.15 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.98 
 
 
259 aa  211  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  47.32 
 
 
639 aa  211  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  42.56 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.6 
 
 
261 aa  209  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.94 
 
 
303 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.53 
 
 
263 aa  209  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.26 
 
 
260 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  43.28 
 
 
245 aa  205  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  43.15 
 
 
647 aa  205  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  41.39 
 
 
637 aa  204  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.97 
 
 
270 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 
260 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  39.75 
 
 
252 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  39.75 
 
 
252 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.74 
 
 
268 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.43 
 
 
260 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  46.99 
 
 
637 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  46.06 
 
 
234 aa  202  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.53 
 
 
266 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  44.58 
 
 
642 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  42.56 
 
 
259 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  42.21 
 
 
642 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  43.28 
 
 
646 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  41.13 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.32 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  37.97 
 
 
240 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1006  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  39.26 
 
 
655 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156439 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  38.96 
 
 
339 aa  191  8e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.92 
 
 
266 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.6 
 
 
252 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  42.66 
 
 
262 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.86 
 
 
261 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.52 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  42.02 
 
 
657 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.52 
 
 
266 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.52 
 
 
266 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.52 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.18 
 
 
261 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.71 
 
 
266 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  39.11 
 
 
276 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.76 
 
 
268 aa  186  3e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.92 
 
 
260 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.1 
 
 
266 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.1 
 
 
266 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.1 
 
 
266 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.1 
 
 
266 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.1 
 
 
266 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.36 
 
 
270 aa  185  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.71 
 
 
266 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>