229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0225 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
243 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2815  Glucosamine-6-phosphate deaminase  44.12 
 
 
242 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1615  Glucosamine-6-phosphate deaminase  42.08 
 
 
240 aa  208  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1200  Glucosamine-6-phosphate deaminase  36.67 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3872  Glucosamine-6-phosphate deaminase  38.2 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.66 
 
 
236 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3582  galactosamine-6-phosphate isomerase  40.53 
 
 
236 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.47 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.1 
 
 
250 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.9 
 
 
242 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3333  galactosamine-6-phosphate isomerase  38.72 
 
 
251 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.78 
 
 
253 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.71 
 
 
251 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0564  Glucosamine-6-phosphate deaminase  38.3 
 
 
233 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3623  galactosamine-6-phosphate isomerase  37.93 
 
 
251 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0557  galactosamine-6-phosphate isomerase  38.3 
 
 
233 aa  168  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03008  galactosamine-6-phosphate isomerase  38.3 
 
 
251 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02959  hypothetical protein  38.3 
 
 
251 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3440  galactosamine-6-phosphate isomerase  38.14 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.05 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.36 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  38.89 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.19 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 
256 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  35 
 
 
245 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.47 
 
 
249 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.81 
 
 
242 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.2 
 
 
256 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.29 
 
 
262 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.29 
 
 
262 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  37.91 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.32 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.86 
 
 
262 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.67 
 
 
247 aa  145  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.39 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.02 
 
 
233 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.72 
 
 
233 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  33.82 
 
 
252 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  33.82 
 
 
252 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 
642 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  36.49 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.61 
 
 
268 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  34.3 
 
 
339 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  32.17 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.22 
 
 
263 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.19 
 
 
242 aa  135  8e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1208  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.39 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.74 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 
236 aa  132  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.37 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.54 
 
 
264 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.85 
 
 
259 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  32.1 
 
 
260 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3512  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.77 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.73 
 
 
657 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.23 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.86 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  36.04 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05361  6-phosphogluconolactonase/glucosamine-6- phosphate isomerase/deaminase  34.07 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.11 
 
 
266 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.82 
 
 
266 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01418  glucosamine-6-phosphate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G00480)  30.74 
 
 
358 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313025  normal  0.0950866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.75 
 
 
268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.4 
 
 
266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.15 
 
 
260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.78 
 
 
266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.86 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 
303 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.69 
 
 
642 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.29 
 
 
263 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  30.58 
 
 
647 aa  123  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  30 
 
 
260 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.05 
 
 
266 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.29 
 
 
262 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 
276 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 
279 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.72 
 
 
670 aa  121  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.6 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.19 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62706  Glucosamine-6-phosphate isomerase (Glucosamine-6-phosphate deaminase) (GNPDA) (GlcN6P deaminase)  30.13 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  29 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  33.8 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1027  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.31 
 
 
268 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.16 
 
 
261 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.1 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.67 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.22 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2959  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.22 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485164  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00626  hypothetical protein  30.22 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0722  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.22 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.372156  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  29.83 
 
 
637 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>