22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3503 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  61.29 
 
 		 1168 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  48.48 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  45.59 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  35.48 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  44 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  44.62 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2594  hypothetical protein  48.44 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  27.1 
 
 		 481 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  27.1 
 
 		 478 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  45.45 
 
 		 706 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  65.62 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  50.88 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  62.86 
 
 		 473 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  32.35 
 
 		 366 aa  43.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  66.67 
 
 		 438 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  67.74 
 
 		 1297 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  46.27 
 
 		 437 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  67.57 
 
 		 835 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  67.74 
 
 		 1321 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  46.27 
 
 		 451 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  45.9 
 
 		 437 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>