17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0787 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1181    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  68.7 
 
 		 1101 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  51.88 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  57.51 
 
 		 953 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  36.09 
 
 		 538 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  50.55 
 
 		 249 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  51.81 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  52.31 
 
 		 496 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  44 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00605  hypothetical protein  30.32 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171215  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00620  hypothetical protein  42.55 
 
 		 493 aa  50.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1168 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3503  hypothetical protein  30.99 
 
 		 333 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00183047  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00630  hypothetical protein  32.22 
 
 		 277 aa  47.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02580  hypothetical protein  38 
 
 		 247 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00610  hypothetical protein  37.68 
 
 		 276 aa  45.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05505  lysyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0927003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>