26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3850 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  100 
 
 		 781 aa  1561    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  34.06 
 
 		 461 aa  94  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1168 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0538  hypothetical protein  36.99 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0846503  normal  0.864098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  31.52 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  31.36 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  30.81 
 
 		 397 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  28.96 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  35.11 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1037 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  34 
 
 		 689 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  35.14 
 
 		 656 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  30.71 
 
 		 530 aa  55.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  30.71 
 
 		 530 aa  55.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  30.71 
 
 		 530 aa  55.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3851  hypothetical protein  39.64 
 
 		 189 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4089  metallophosphoesterase  34.78 
 
 		 716 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  30 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2510  hypothetical protein  33.53 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  39.29 
 
 		 317 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1519  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1910 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.387558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  30.4 
 
 		 399 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  26.95 
 
 		 346 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28282  predicted protein  34.38 
 
 		 3288 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1097 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>