17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0533 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  43.82 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  33.55 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  32.86 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  36.84 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  30.23 
 
 		 650 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  33.01 
 
 		 456 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  36.8 
 
 		 1258 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  33.62 
 
 		 790 aa  52.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  41.54 
 
 		 1137 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  26.03 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  32 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  40 
 
 		 1120 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  33.02 
 
 		 899 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  34.95 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  32.67 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 735 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>