45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1042 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  100 
 
 
469 aa  949    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  30.86 
 
 
701 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  27.91 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  28.69 
 
 
670 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  28.69 
 
 
670 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  27.14 
 
 
514 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  30.96 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  25.24 
 
 
364 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  54.02 
 
 
1120 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  43.44 
 
 
1137 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  63.93 
 
 
1007 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  30.31 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  36.46 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  44.78 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  61.29 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  29.31 
 
 
892 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  29.6 
 
 
588 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  29.6 
 
 
561 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  56.06 
 
 
172 aa  57  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  56.06 
 
 
536 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  64.44 
 
 
516 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  50 
 
 
570 aa  53.5  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0739  hypothetical protein  30.91 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.495796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0698  hypothetical protein  30.91 
 
 
412 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  44.93 
 
 
673 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  42.22 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  63.41 
 
 
645 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  62.5 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  62.5 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  56.25 
 
 
805 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  26.03 
 
 
378 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  54.17 
 
 
790 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2704  prophage MuSo2, tail fiber protein, putative  48.94 
 
 
575 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  54.17 
 
 
463 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  65.79 
 
 
791 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  54.17 
 
 
280 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  30.88 
 
 
363 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  58.54 
 
 
962 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  57.45 
 
 
583 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  66.67 
 
 
552 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  62.16 
 
 
581 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  43.5  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  62.16 
 
 
493 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>