53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1333 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  100 
 
 
790 aa  1598    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0190  hypothetical protein  56.06 
 
 
569 aa  343  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  77.49 
 
 
536 aa  295  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  52.83 
 
 
735 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  51.5 
 
 
656 aa  165  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  42.18 
 
 
616 aa  163  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  46.47 
 
 
501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  46.28 
 
 
530 aa  148  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  46.28 
 
 
530 aa  148  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  45.74 
 
 
323 aa  147  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  45.74 
 
 
530 aa  147  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  58.89 
 
 
387 aa  112  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 
483 aa  98.2  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  33.33 
 
 
654 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  33.33 
 
 
654 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  44.14 
 
 
440 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1058  hypothetical protein  58.33 
 
 
468 aa  77  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0245225  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  30 
 
 
414 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  39.83 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  29.29 
 
 
414 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  29.29 
 
 
387 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  37.8 
 
 
817 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1690  hypothetical protein  51.61 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  31.94 
 
 
554 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1636  hypothetical protein  45.59 
 
 
471 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  29.41 
 
 
472 aa  61.6  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  29.46 
 
 
225 aa  61.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  42.57 
 
 
505 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  34.86 
 
 
262 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  33.62 
 
 
378 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  31.68 
 
 
439 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  31.67 
 
 
228 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  33.98 
 
 
492 aa  51.2  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5519  hypothetical protein  41.77 
 
 
399 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  34.26 
 
 
180 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  34.13 
 
 
646 aa  50.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  36.63 
 
 
259 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  36.63 
 
 
259 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  25.89 
 
 
323 aa  50.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  34.26 
 
 
179 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  35.44 
 
 
1120 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  31.33 
 
 
557 aa  48.9  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  33.58 
 
 
899 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  26.5 
 
 
414 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  35.44 
 
 
1137 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
485 aa  48.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  28.03 
 
 
443 aa  47.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  37.11 
 
 
530 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  35.05 
 
 
682 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  29.8 
 
 
516 aa  46.2  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  26.56 
 
 
177 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  30.95 
 
 
176 aa  44.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  32.48 
 
 
340 aa  44.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>