75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4480 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 492 aa  964    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  43.29 
 
 		 225 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  42.31 
 
 		 554 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  36.61 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  39.87 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  44.95 
 
 		 654 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  44.95 
 
 		 654 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  32.18 
 
 		 323 aa  88.2  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  48.28 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6581  hypothetical protein  32.91 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  32.27 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  50 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1424  hypothetical protein  37.98 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.718743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1427  hypothetical protein  43.59 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000465775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4816  hypothetical protein  43.59 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  28.03 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  56.6 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  31.29 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  33.59 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1722  hypothetical protein  30.38 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  53.23 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  35.66 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  36.27 
 
 		 536 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  52.38 
 
 		 282 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  34.65 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  36.28 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  38.2 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  38.2 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  45.07 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  38.37 
 
 		 176 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  39.29 
 
 		 682 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  35.14 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  37.21 
 
 		 177 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  36.36 
 
 		 735 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  38.89 
 
 		 557 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  33.99 
 
 		 530 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  33.98 
 
 		 790 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  29.13 
 
 		 498 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  38.55 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  33.64 
 
 		 166 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  47.27 
 
 		 80 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  29.1 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  31.41 
 
 		 532 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  34.71 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  36 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  31.25 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  38.67 
 
 		 646 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  41.38 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 		 387 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 		 259 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 		 259 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  46.67 
 
 		 261 aa  47  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  36.51 
 
 		 306 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  35.05 
 
 		 176 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  30.95 
 
 		 505 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  37.35 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  34.91 
 
 		 157 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  39.71 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  38.36 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2243  hypothetical protein  40.51 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  29.3 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 87 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  34.25 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  28.75 
 
 		 172 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  34.62 
 
 		 176 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  36.14 
 
 		 196 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  33.8 
 
 		 179 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  31.73 
 
 		 176 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  31.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  31.39 
 
 		 170 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  46.15 
 
 		 80 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>