59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00848 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  64.48 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  61.75 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  58.1 
 
 		 262 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  48.84 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  48.26 
 
 		 259 aa  148  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  45.96 
 
 		 557 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  47.24 
 
 		 340 aa  138  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  43.68 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  46.51 
 
 		 498 aa  137  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  44.27 
 
 		 401 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  44.79 
 
 		 485 aa  134  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.45 
 
 		 371 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  49.69 
 
 		 646 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  44.38 
 
 		 402 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  45.68 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  45.96 
 
 		 621 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  43.12 
 
 		 682 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  44.87 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  40.72 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  39.44 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  34.21 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  32.93 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  34.83 
 
 		 483 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  33.7 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  33.33 
 
 		 580 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  35.53 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  33.52 
 
 		 817 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  36.13 
 
 		 554 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  28.11 
 
 		 1007 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  43.59 
 
 		 962 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  30.67 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  39.62 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  42.17 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  41.05 
 
 		 654 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  41.05 
 
 		 654 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  30.73 
 
 		 790 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  44.59 
 
 		 1120 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  30.73 
 
 		 805 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  30.73 
 
 		 569 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  30.73 
 
 		 463 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  43.24 
 
 		 1137 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  42.11 
 
 		 441 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  43.24 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  26.9 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  33.93 
 
 		 530 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  41.89 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  41.89 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  30.57 
 
 		 791 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  41.89 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  42.55 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  41.03 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  26.29 
 
 		 735 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  38.2 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  30.09 
 
 		 536 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  34.26 
 
 		 790 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  24.19 
 
 		 368 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  28.26 
 
 		 282 aa  40.8  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>