72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2492 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  45.9 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  45.52 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  57.71 
 
 		 177 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  58.14 
 
 		 176 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  58.1 
 
 		 180 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  58.19 
 
 		 179 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  71.82 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  49.69 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  47.72 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  91.95 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  45.76 
 
 		 166 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  46.67 
 
 		 401 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  45.62 
 
 		 682 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  45.16 
 
 		 557 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  45.16 
 
 		 646 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  44.31 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  41.67 
 
 		 498 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  42.77 
 
 		 485 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  45.16 
 
 		 689 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  43.83 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  40.35 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  44.91 
 
 		 621 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  42.24 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  49.57 
 
 		 514 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  49.57 
 
 		 520 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  62.16 
 
 		 364 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  59.74 
 
 		 413 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  33.71 
 
 		 817 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.53 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  34.78 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  35.76 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  41.44 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  33.9 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  32.05 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  32.34 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  34.87 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  40 
 
 		 962 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  31.18 
 
 		 530 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  31.25 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  50.72 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  32 
 
 		 654 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  32 
 
 		 654 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  44.93 
 
 		 1120 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  38.82 
 
 		 1007 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  43.48 
 
 		 1137 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  44.78 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  43.48 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  31.05 
 
 		 790 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  31.05 
 
 		 805 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  31.05 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  25.82 
 
 		 516 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  30.57 
 
 		 569 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  43.28 
 
 		 536 aa  62  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  43.28 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  40 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  28.04 
 
 		 735 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  34.65 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  38.27 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  33.64 
 
 		 536 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  40.26 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  38.27 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  30.89 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  37.5 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  34.83 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  37.18 
 
 		 442 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  34.86 
 
 		 790 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  23.78 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  31.18 
 
 		 168 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1105  Tail Collar domain protein  25.56 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  33.96 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  29.91 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>