50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0873 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  100 
 
 		 441 aa  893    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  89.52 
 
 		 1137 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  77.93 
 
 		 1120 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  66.92 
 
 		 536 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  56.31 
 
 		 1007 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  74.14 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  74.14 
 
 		 281 aa  335  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  55.89 
 
 		 516 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  61.34 
 
 		 962 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  55.89 
 
 		 569 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  55.89 
 
 		 463 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  55.13 
 
 		 805 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  55.13 
 
 		 790 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  54.55 
 
 		 791 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  54.62 
 
 		 580 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  68.85 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  40.85 
 
 		 682 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  48.25 
 
 		 570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  46.51 
 
 		 304 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.88 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  45.26 
 
 		 557 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  28.77 
 
 		 689 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  46.75 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.68 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  46.34 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  44.44 
 
 		 179 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  44.44 
 
 		 180 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  47.3 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  44.16 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  58.82 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  37.11 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  45.68 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  36.08 
 
 		 176 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  39.08 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  41.98 
 
 		 892 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.04 
 
 		 621 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  45.71 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  49.02 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  39.51 
 
 		 520 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.56 
 
 		 144 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  32.94 
 
 		 530 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  37.66 
 
 		 532 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  26.06 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  27.04 
 
 		 501 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  35.44 
 
 		 140 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  34.26 
 
 		 157 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  35.53 
 
 		 140 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>