81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1577 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 682 aa  1406    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  75.36 
 
 		 462 aa  211  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  52.79 
 
 		 1007 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  35.89 
 
 		 621 aa  188  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  59.21 
 
 		 646 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  58.33 
 
 		 166 aa  184  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  53.45 
 
 		 689 aa  180  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  56.08 
 
 		 304 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  58.6 
 
 		 259 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.17 
 
 		 697 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  58.97 
 
 		 259 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  51.61 
 
 		 340 aa  158  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  62.39 
 
 		 280 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.98 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  45.93 
 
 		 498 aa  144  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  45.35 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  50.66 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  44.31 
 
 		 485 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  45.62 
 
 		 262 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  38.97 
 
 		 196 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  48.73 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  48.73 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  45.4 
 
 		 183 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  43.12 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  41.1 
 
 		 441 aa  120  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  43.12 
 
 		 179 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  37.04 
 
 		 1137 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  37.04 
 
 		 1120 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 402 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  43.31 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  42.47 
 
 		 157 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  42.76 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  41.1 
 
 		 140 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 140 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  42.86 
 
 		 320 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  34.39 
 
 		 264 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  51.35 
 
 		 962 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  41.82 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  48.19 
 
 		 452 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  50 
 
 		 516 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  50 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  45.79 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  63.64 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  68.75 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  68.75 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  32.45 
 
 		 144 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  47.83 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  33.12 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  35.06 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  64.58 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  37.38 
 
 		 805 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  38.32 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  37.38 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  27.94 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  38.32 
 
 		 569 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  30.86 
 
 		 817 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  38.83 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  48.57 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  58 
 
 		 735 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  37.38 
 
 		 442 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1088  hypothetical protein  54.17 
 
 		 712 aa  61.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.979712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1223  hypothetical protein  47.37 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  63.41 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  38.2 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  29.27 
 
 		 671 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  36.11 
 
 		 791 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  31.08 
 
 		 527 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  39.29 
 
 		 492 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  51.79 
 
 		 419 aa  54.3  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  43.33 
 
 		 570 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  28.85 
 
 		 323 aa  52  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  28.67 
 
 		 536 aa  51.2  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  37.66 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  38.1 
 
 		 519 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  52.08 
 
 		 364 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  37.66 
 
 		 654 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  33.07 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  35.05 
 
 		 790 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  32.91 
 
 		 368 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  59.46 
 
 		 514 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  59.46 
 
 		 520 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>