69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00845 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1092    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1092    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  95.49 
 
 		 473 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  64.91 
 
 		 697 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  83.66 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  71.21 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  79.77 
 
 		 561 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  51.57 
 
 		 583 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  51.16 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  65.18 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  67.61 
 
 		 646 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  65.74 
 
 		 419 aa  293  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  47.53 
 
 		 570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  60.27 
 
 		 498 aa  282  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  61.74 
 
 		 557 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  71.11 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  51.95 
 
 		 673 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  59.72 
 
 		 371 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  60.47 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  65.56 
 
 		 340 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  59.26 
 
 		 452 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  73.08 
 
 		 660 aa  246  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  55.65 
 
 		 621 aa  200  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  53.98 
 
 		 689 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  56.35 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  58.06 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  54.65 
 
 		 554 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  57.6 
 
 		 689 aa  190  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.42 
 
 		 714 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  54.43 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  41.18 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  41.67 
 
 		 552 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  41.18 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  48.88 
 
 		 580 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  47.1 
 
 		 251 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  64.29 
 
 		 962 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  44.94 
 
 		 691 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  43.53 
 
 		 817 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  60.34 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  64.08 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  36.65 
 
 		 242 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  59.48 
 
 		 892 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  38.55 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  58.04 
 
 		 790 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  58.04 
 
 		 791 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  40.13 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  58.62 
 
 		 280 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  59.48 
 
 		 805 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  39.62 
 
 		 205 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  32.72 
 
 		 359 aa  99  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  33.63 
 
 		 299 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  33.16 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  43.64 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  35.71 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  56.25 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  60.81 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  68.75 
 
 		 682 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  33.77 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  59.32 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  44.3 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  31.13 
 
 		 590 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0301  putative tail fiber protein  50 
 
 		 136 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  53.5  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  64.86 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  57.45 
 
 		 387 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  29.75 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  31.07 
 
 		 228 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1494  hypothetical protein  47.17 
 
 		 380 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>