67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3035 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  100 
 
 
399 aa  820    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  71.98 
 
 
473 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  71.21 
 
 
540 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  71.21 
 
 
540 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  65.12 
 
 
588 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  68.25 
 
 
697 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  61.21 
 
 
561 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  81.11 
 
 
340 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  65.18 
 
 
401 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  66.67 
 
 
646 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  63.85 
 
 
485 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.56 
 
 
419 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  70 
 
 
479 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  67.44 
 
 
557 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  65.12 
 
 
498 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  56.36 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0301  putative tail fiber protein  98.39 
 
 
136 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  58.6 
 
 
399 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  54.75 
 
 
452 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  70.51 
 
 
660 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  37.82 
 
 
673 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  64.12 
 
 
583 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  54.29 
 
 
689 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  60 
 
 
714 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  51.11 
 
 
504 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  38.82 
 
 
554 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  48.72 
 
 
554 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  44.5 
 
 
570 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  47.46 
 
 
580 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  42.5 
 
 
581 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  42 
 
 
493 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  42 
 
 
552 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  46.25 
 
 
691 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  35.56 
 
 
242 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  40.76 
 
 
251 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  37.99 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  38.01 
 
 
817 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  60.24 
 
 
462 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  55.21 
 
 
463 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  36.18 
 
 
483 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  36.02 
 
 
359 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  44.74 
 
 
689 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  47.17 
 
 
621 aa  103  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  35.33 
 
 
962 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  51.04 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  35.85 
 
 
205 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  53.12 
 
 
892 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  52.13 
 
 
790 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  52.13 
 
 
791 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  57.33 
 
 
280 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  36.69 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  33.15 
 
 
519 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  55.26 
 
 
805 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  35.46 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  45.16 
 
 
264 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  64.58 
 
 
682 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  52.05 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  48.65 
 
 
522 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1051  hypothetical protein  37.08 
 
 
232 aa  59.7  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  30.07 
 
 
525 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  50.88 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  28.08 
 
 
590 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  36.36 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  36.71 
 
 
639 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1494  hypothetical protein  51.11 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  53.85 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  44.19 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>