54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1305 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  100 
 
 
505 aa  1015    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  32.43 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  35.82 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  37.5 
 
 
552 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  37.5 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  37.5 
 
 
493 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  42.54 
 
 
660 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  38.86 
 
 
570 aa  129  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  34.38 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  40.78 
 
 
697 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.69 
 
 
504 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  35.14 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  39.56 
 
 
583 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  37.99 
 
 
399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  39.38 
 
 
673 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  37.43 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.43 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  37.43 
 
 
646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  39.05 
 
 
580 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  38.55 
 
 
561 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  38.55 
 
 
540 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  38.55 
 
 
540 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  34.92 
 
 
554 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.55 
 
 
473 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  37.43 
 
 
399 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  36.31 
 
 
479 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  34.64 
 
 
485 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.56 
 
 
483 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  36.96 
 
 
588 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  36.31 
 
 
557 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.58 
 
 
452 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  34.76 
 
 
242 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  33.72 
 
 
817 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  34.91 
 
 
689 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  41.04 
 
 
387 aa  90.9  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  39.16 
 
 
554 aa  87  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  35.29 
 
 
714 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  35.62 
 
 
251 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  32.89 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  44.04 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  33.53 
 
 
205 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  34.53 
 
 
691 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  22.28 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  43.14 
 
 
735 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  44.55 
 
 
790 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  29.41 
 
 
299 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  29.87 
 
 
525 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  33.71 
 
 
200 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  41.76 
 
 
298 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  43.18 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  28.18 
 
 
616 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  30.95 
 
 
492 aa  47  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  27.5 
 
 
530 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>