19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2509 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  737    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0934  hypothetical protein  52.44 
 
 
378 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0935  hypothetical protein  52.87 
 
 
393 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1448  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0626  hypothetical protein  23.75 
 
 
722 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.374828  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0689  Phage related protein  23.75 
 
 
722 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0207675  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  28.22 
 
 
479 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  25.33 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  25.48 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  26.67 
 
 
498 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  30 
 
 
660 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  33.71 
 
 
554 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  28.06 
 
 
561 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  26.67 
 
 
697 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  28.76 
 
 
473 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  28.87 
 
 
540 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  27.59 
 
 
583 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  28.87 
 
 
540 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  25.37 
 
 
557 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>