98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3816 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 498 aa  999    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  53.06 
 
 		 401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.71 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  82.88 
 
 		 557 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  82.16 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  80.66 
 
 		 646 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  61.95 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  60.27 
 
 		 540 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  60.27 
 
 		 540 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  71.62 
 
 		 419 aa  320  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  65.9 
 
 		 371 aa  289  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  65.12 
 
 		 399 aa  289  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  64.13 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  66.67 
 
 		 452 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  63 
 
 		 479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  65.7 
 
 		 561 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  68.89 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  75.48 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  58.14 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  70.78 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  61.59 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  60.13 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  62.75 
 
 		 714 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  61.18 
 
 		 689 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  40.78 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  48.87 
 
 		 673 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  54.25 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  52.46 
 
 		 166 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  50.33 
 
 		 493 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  50.33 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  50.33 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  56.49 
 
 		 580 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  48.28 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  45.93 
 
 		 682 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  50.59 
 
 		 259 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  47.88 
 
 		 183 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  50.89 
 
 		 259 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  46.51 
 
 		 180 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  46.51 
 
 		 179 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  44.91 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  44.3 
 
 		 691 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  45.56 
 
 		 196 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  47.95 
 
 		 621 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  44.32 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  41.56 
 
 		 251 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  43.18 
 
 		 177 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  41.67 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  40.13 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  37.43 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  41.61 
 
 		 817 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  28.23 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  38.16 
 
 		 242 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  34.46 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  39.16 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  31.8 
 
 		 264 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  38.65 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  56.9 
 
 		 962 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  30.39 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  50 
 
 		 1120 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  58.82 
 
 		 1007 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  49.25 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 320 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  50 
 
 		 1137 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  50 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  49.25 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  48.53 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  42.39 
 
 		 157 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  42.39 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  30.54 
 
 		 144 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  31.31 
 
 		 805 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  31.31 
 
 		 790 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  31.79 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  48.44 
 
 		 140 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  30.81 
 
 		 463 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  30.81 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  36.28 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  35.46 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  31.79 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  30.65 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  33.1 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  34.62 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  41.18 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  50 
 
 		 671 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  38.1 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  34.71 
 
 		 440 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  36.11 
 
 		 323 aa  55.1  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  42.25 
 
 		 654 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  43.28 
 
 		 654 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  25.93 
 
 		 536 aa  53.5  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  29.13 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  65.79 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1308  hypothetical protein  30.77 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  34.67 
 
 		 790 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 368 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  26.67 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  51.16 
 
 		 465 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>