53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2345 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  988    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  75.56 
 
 		 697 aa  286  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  71.35 
 
 		 340 aa  283  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  70 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  72.22 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  72.22 
 
 		 498 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.12 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  68.33 
 
 		 485 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  68.89 
 
 		 419 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  68.89 
 
 		 646 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  73.33 
 
 		 561 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  71.11 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  71.11 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  71.67 
 
 		 588 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  72.22 
 
 		 557 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  76.62 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  73.91 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  58.89 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  71.9 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.78 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  45.41 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  53.85 
 
 		 504 aa  189  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  60.39 
 
 		 714 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  53.14 
 
 		 689 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  58.17 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  51.55 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  57.97 
 
 		 673 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  54.81 
 
 		 580 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2185  hypothetical protein  88.89 
 
 		 95 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  47.47 
 
 		 552 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  47.47 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  48.37 
 
 		 581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.59 
 
 		 251 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  44.03 
 
 		 691 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  42.38 
 
 		 817 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  36.31 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  35.4 
 
 		 242 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  34.05 
 
 		 205 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  32.73 
 
 		 359 aa  97.4  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  35.14 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  32.58 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  47.06 
 
 		 408 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  49.48 
 
 		 589 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  47.06 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  28.78 
 
 		 382 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  35.4 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  36.84 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  32.26 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  66.67 
 
 		 238 aa  57  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  28.22 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  33.04 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  31.07 
 
 		 228 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1245  Ig-like domain-containing protein  44.68 
 
 		 593 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>