75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0940 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  100 
 
 
583 aa  1157    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  48.54 
 
 
570 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  57.01 
 
 
552 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  55.76 
 
 
581 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  50.41 
 
 
493 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  52.53 
 
 
540 aa  312  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  52.53 
 
 
540 aa  312  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.31 
 
 
473 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  73.58 
 
 
660 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  52.37 
 
 
673 aa  294  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  91.14 
 
 
588 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  92.41 
 
 
561 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  59.23 
 
 
580 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  40.61 
 
 
697 aa  258  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  74.68 
 
 
479 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  58.25 
 
 
554 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  64.12 
 
 
399 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  68.35 
 
 
340 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  66.28 
 
 
401 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  69.18 
 
 
399 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  70.78 
 
 
498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  73.38 
 
 
557 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  68.35 
 
 
485 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  67.72 
 
 
646 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  67.72 
 
 
419 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  58.62 
 
 
504 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  62.89 
 
 
371 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  62.26 
 
 
452 aa  206  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  57.31 
 
 
689 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.6 
 
 
714 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  57.96 
 
 
554 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  47.1 
 
 
251 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  42.77 
 
 
691 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  58.71 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  58.71 
 
 
516 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  44.87 
 
 
817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  39.56 
 
 
505 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  40.52 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  35.27 
 
 
242 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  40.13 
 
 
205 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  63.54 
 
 
1007 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  33.33 
 
 
359 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  36.53 
 
 
299 aa  88.2  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  35.85 
 
 
519 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  60.94 
 
 
701 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00754  hypothetical protein  68.42 
 
 
68 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10057  Tail fiber  68.42 
 
 
87 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  35.71 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  69.64 
 
 
510 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  52.63 
 
 
670 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  52.63 
 
 
670 aa  74.7  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  59.7 
 
 
264 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  33.54 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  39.19 
 
 
690 aa  68.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  48.54 
 
 
261 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  57.89 
 
 
589 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  29.81 
 
 
590 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  58.7 
 
 
531 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  34.68 
 
 
962 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  72.5 
 
 
1120 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  76.92 
 
 
1137 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  36.59 
 
 
463 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  65.12 
 
 
172 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  74.36 
 
 
401 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  74.36 
 
 
401 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  50.91 
 
 
645 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  35.46 
 
 
790 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  69.05 
 
 
408 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  57.45 
 
 
469 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  63.64 
 
 
791 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  77.42 
 
 
280 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  30.46 
 
 
362 aa  47.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  61.36 
 
 
805 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  61.36 
 
 
892 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1449  hypothetical protein  38.75 
 
 
298 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>