99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4031 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  100 
 
 
485 aa  983    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  76.97 
 
 
646 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.62 
 
 
697 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  82.55 
 
 
498 aa  323  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  73.27 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  74.18 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.31 
 
 
473 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  51.16 
 
 
540 aa  299  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  51.16 
 
 
540 aa  299  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  79.25 
 
 
557 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  59.92 
 
 
371 aa  296  7e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  63.85 
 
 
399 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.46 
 
 
452 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  62.66 
 
 
588 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  68.33 
 
 
479 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  64.25 
 
 
561 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  66.11 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  70.78 
 
 
660 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  53.99 
 
 
399 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  68.35 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.14 
 
 
714 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  37.26 
 
 
570 aa  182  8.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  49.3 
 
 
673 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  53.71 
 
 
689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.9 
 
 
504 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  52.94 
 
 
554 aa  170  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  52.94 
 
 
554 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  50.31 
 
 
580 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  51.92 
 
 
166 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  52.44 
 
 
689 aa  150  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  51.05 
 
 
183 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  37.36 
 
 
402 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  42.41 
 
 
552 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  43.79 
 
 
581 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  42.41 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  44.31 
 
 
682 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  48.97 
 
 
196 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  44.79 
 
 
179 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  44.79 
 
 
180 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  50 
 
 
259 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  45.86 
 
 
691 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  50.98 
 
 
259 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  46.54 
 
 
176 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  46.54 
 
 
177 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  44.51 
 
 
621 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  42.77 
 
 
262 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  29.3 
 
 
817 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  34.64 
 
 
505 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  36.13 
 
 
251 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  39.47 
 
 
264 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  36 
 
 
205 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  40.54 
 
 
242 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  35.81 
 
 
483 aa  94  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  29.82 
 
 
359 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  30.26 
 
 
519 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  42.42 
 
 
1007 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  36.6 
 
 
530 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  49.4 
 
 
320 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  51.47 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  35 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  52.94 
 
 
1120 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  51.47 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  34.48 
 
 
140 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  51.47 
 
 
1137 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  51.47 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  34.91 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  48.19 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  52.63 
 
 
962 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  33.33 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  33.78 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  32.86 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  30.22 
 
 
140 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  33.11 
 
 
225 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  49.25 
 
 
805 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  37.6 
 
 
735 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  49.25 
 
 
790 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  47.76 
 
 
463 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  47.76 
 
 
569 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  30.46 
 
 
525 aa  63.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  32.37 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  46.27 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  35.48 
 
 
387 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  34.4 
 
 
536 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  29.66 
 
 
590 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  45.59 
 
 
791 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  34.15 
 
 
323 aa  54.7  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  27.56 
 
 
671 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  30.98 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  38.46 
 
 
654 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  38.46 
 
 
654 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2930  Ig-like domain-containing protein  36.9 
 
 
593 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  31.25 
 
 
492 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  33.33 
 
 
790 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  40 
 
 
368 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  67.65 
 
 
397 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1245  Ig-like domain-containing protein  39.71 
 
 
593 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2509  hypothetical protein  25.48 
 
 
362 aa  48.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  26.53 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  26.53 
 
 
408 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>