76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1090 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  85.34 
 
 		 791 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  100 
 
 		 463 aa  937    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  87.04 
 
 		 790 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  96.54 
 
 		 805 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  98.39 
 
 		 569 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  91.92 
 
 		 442 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  45.8 
 
 		 962 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  57.31 
 
 		 1007 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  59.06 
 
 		 320 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  58.1 
 
 		 281 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  73.3 
 
 		 580 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  80.45 
 
 		 892 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  58.54 
 
 		 1120 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  78.69 
 
 		 280 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  56.27 
 
 		 1137 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  36.27 
 
 		 516 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  55.89 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  35.48 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  51.09 
 
 		 673 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  51.45 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  61.4 
 
 		 473 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  60.34 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  60.34 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  57.5 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  55.21 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  44.2 
 
 		 621 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  42.6 
 
 		 689 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  50.45 
 
 		 561 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  41.18 
 
 		 697 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  62.5 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  50.52 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  30.73 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  30.73 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  31.35 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  30 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  38.32 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  30.81 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  47.76 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  47.83 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  29.95 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  27 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  31.05 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  68.89 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  68.89 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  50.98 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  73.68 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  47.76 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  38.33 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  62.75 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  65.91 
 
 		 172 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  34.78 
 
 		 177 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  33.7 
 
 		 176 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  34.29 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  45.1 
 
 		 183 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  36.89 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  43.14 
 
 		 196 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  58.14 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  58.14 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  65.79 
 
 		 645 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  54.17 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  56.82 
 
 		 701 aa  50.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  37.84 
 
 		 144 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  65.12 
 
 		 583 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  63.16 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  63.16 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  63.16 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  24.86 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  100 
 
 		 293 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  67.57 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0928  tail fiber  29.66 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.54559  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0910  hypothetical protein  29.66 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  51.06 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  30.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  29.17 
 
 		 397 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  62.86 
 
 		 554 aa  43.5  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>