58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2758 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  96.59 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  64.67 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  64.48 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  58.14 
 
 		 262 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  52.07 
 
 		 259 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  51.48 
 
 		 259 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  44.51 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  48.73 
 
 		 340 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  46.45 
 
 		 557 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.16 
 
 		 371 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  48.39 
 
 		 646 aa  131  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  45.91 
 
 		 485 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  48.73 
 
 		 682 aa  127  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  40.32 
 
 		 401 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  44.71 
 
 		 498 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  43.51 
 
 		 402 aa  122  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  44.03 
 
 		 689 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  40.8 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  45.68 
 
 		 621 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  43.12 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  37.57 
 
 		 264 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  35.75 
 
 		 817 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  32.67 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  52.44 
 
 		 554 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  36.05 
 
 		 483 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  32.53 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  39.25 
 
 		 387 aa  70.9  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  32.28 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  42.7 
 
 		 654 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  36.84 
 
 		 1007 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  42.7 
 
 		 654 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  42.86 
 
 		 532 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  42.86 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  33.33 
 
 		 671 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  27.75 
 
 		 323 aa  67  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  42.31 
 
 		 962 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  46.27 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  45.95 
 
 		 1120 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  44.59 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  44.59 
 
 		 1137 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  45.83 
 
 		 320 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 		 530 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  42.5 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  44.44 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  44.44 
 
 		 536 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  26.98 
 
 		 735 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  35.87 
 
 		 805 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  35.87 
 
 		 790 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  31.4 
 
 		 536 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  33.68 
 
 		 569 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  35.42 
 
 		 442 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  34.78 
 
 		 463 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  37.21 
 
 		 492 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  34.74 
 
 		 791 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  32 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  30.95 
 
 		 790 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>