60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1819 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 166 aa  336  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  65.1 
 
 		 646 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  58.58 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  58.58 
 
 		 259 aa  184  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  56.25 
 
 		 682 aa  184  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  56.59 
 
 		 401 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  56.77 
 
 		 689 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  53.8 
 
 		 340 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  52.46 
 
 		 498 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  56.77 
 
 		 621 aa  161  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  53.46 
 
 		 371 aa  153  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  51.92 
 
 		 485 aa  151  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  52 
 
 		 557 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  45.05 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  43.68 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  43.68 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  44.51 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  45.76 
 
 		 262 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  42.13 
 
 		 183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  44.65 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  46.25 
 
 		 402 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  47.14 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  45 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  48.92 
 
 		 532 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  48.92 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  42 
 
 		 530 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  40.24 
 
 		 264 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  38.68 
 
 		 1007 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  50.68 
 
 		 1120 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  34.69 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  49.32 
 
 		 1137 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  49.32 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  49.32 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  48.61 
 
 		 536 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  38.1 
 
 		 516 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  34.06 
 
 		 962 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  38.46 
 
 		 580 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  47.95 
 
 		 281 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  32.37 
 
 		 483 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  31.35 
 
 		 569 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  31.35 
 
 		 463 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  30.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  36.08 
 
 		 554 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  31.32 
 
 		 805 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  31.32 
 
 		 790 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  41.6 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  29.38 
 
 		 817 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  35.96 
 
 		 387 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  42.86 
 
 		 442 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  30.11 
 
 		 791 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  36.84 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  44.12 
 
 		 654 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  44.12 
 
 		 654 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  42.19 
 
 		 671 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  33.64 
 
 		 492 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  40 
 
 		 472 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  25.79 
 
 		 735 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  34.48 
 
 		 536 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 		 368 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  32.69 
 
 		 790 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>