136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0685 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  100 
 
 		 654 aa  1331    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  99.85 
 
 		 654 aa  1329    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  61.72 
 
 		 808 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  42.91 
 
 		 690 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  44.77 
 
 		 527 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  44.01 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  43.45 
 
 		 701 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  43.87 
 
 		 670 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  43.87 
 
 		 670 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  48.1 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  37.13 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  36.96 
 
 		 531 aa  177  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  38.18 
 
 		 768 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  35.13 
 
 		 804 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  47.47 
 
 		 268 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  45.11 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  38.24 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  43.85 
 
 		 225 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  37.7 
 
 		 323 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  27.82 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  34.67 
 
 		 735 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  33.06 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  39.23 
 
 		 249 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  36.49 
 
 		 190 aa  97.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  34.22 
 
 		 492 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  33.78 
 
 		 790 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  34.9 
 
 		 817 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  35.08 
 
 		 443 aa  86.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  45.71 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  28.68 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  42.22 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  32.68 
 
 		 1120 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  41.46 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  43.75 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  34.17 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  42.7 
 
 		 177 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  42.7 
 
 		 176 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  41.05 
 
 		 179 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  41.05 
 
 		 180 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  39.78 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  30.65 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  28.99 
 
 		 1007 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  30.65 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  43.02 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  38.46 
 
 		 300 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  35.29 
 
 		 170 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  30.15 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  31.49 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  37.9 
 
 		 621 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  30.27 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  30.82 
 
 		 259 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  37.86 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  28.22 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  36.19 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  37.37 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  40.43 
 
 		 173 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  44.12 
 
 		 401 aa  57  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  38.89 
 
 		 261 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  30.77 
 
 		 259 aa  55.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  43.37 
 
 		 195 aa  55.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  41.94 
 
 		 181 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  33.64 
 
 		 170 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  39.74 
 
 		 557 aa  54.7  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  43.28 
 
 		 498 aa  54.7  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  41.57 
 
 		 169 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  43.18 
 
 		 157 aa  54.7  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  38.27 
 
 		 364 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  37.07 
 
 		 176 aa  53.9  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  36.73 
 
 		 270 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  31.03 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1105  Tail Collar domain protein  28.16 
 
 		 200 aa  53.9  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  37.63 
 
 		 180 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  31.5 
 
 		 171 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  40.48 
 
 		 179 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  26.24 
 
 		 320 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  36.56 
 
 		 175 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  24.35 
 
 		 441 aa  51.2  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  34.43 
 
 		 163 aa  50.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  43.28 
 
 		 183 aa  50.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  35.09 
 
 		 181 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  36.89 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  32.52 
 
 		 206 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  35.29 
 
 		 199 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 		 485 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  34.11 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  37.66 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  36.21 
 
 		 166 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  37.86 
 
 		 177 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  44.12 
 
 		 326 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  36.56 
 
 		 177 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  37.86 
 
 		 182 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  36.25 
 
 		 264 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  36.56 
 
 		 176 aa  48.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  30.61 
 
 		 186 aa  48.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  30.07 
 
 		 180 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  38.71 
 
 		 178 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  31.85 
 
 		 172 aa  47.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  41.82 
 
 		 80 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>