149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3306 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  982    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  47 
 
 		 242 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  28.49 
 
 		 817 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  44.02 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  42.78 
 
 		 654 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  42.78 
 
 		 654 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  43.41 
 
 		 225 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  37.96 
 
 		 735 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  38.67 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  40.52 
 
 		 583 aa  113  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.56 
 
 		 697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  36.49 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  38.62 
 
 		 646 aa  110  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  36.49 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.51 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  41.22 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  36.49 
 
 		 552 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  40.13 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  40.13 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  40.82 
 
 		 371 aa  107  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  38.56 
 
 		 505 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  40.54 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  38.56 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  36.18 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  32.62 
 
 		 536 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  33.55 
 
 		 504 aa  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  36.6 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  39.46 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.61 
 
 		 492 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  37.16 
 
 		 689 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  34.46 
 
 		 498 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  37.14 
 
 		 401 aa  96.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  31.75 
 
 		 660 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  36.84 
 
 		 673 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  35.14 
 
 		 479 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  35.81 
 
 		 485 aa  94  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  37.21 
 
 		 580 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  31.91 
 
 		 790 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.6 
 
 		 251 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  39.34 
 
 		 554 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  33.75 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.02 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  37.25 
 
 		 205 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  35.66 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.85 
 
 		 714 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  48.94 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  45.08 
 
 		 300 aa  86.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  42.15 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  30.67 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  34.83 
 
 		 179 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  34.83 
 
 		 180 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  36.05 
 
 		 177 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  34.29 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  36.02 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  35.47 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  33.52 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  30.29 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  32.31 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  33.9 
 
 		 262 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  41.54 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  28.35 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  30 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  44.71 
 
 		 183 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  32.37 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  48 
 
 		 264 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  40.17 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  49.28 
 
 		 689 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  38.24 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  49.3 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  38.24 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  48.57 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  38.24 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  39.62 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  49.28 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  46.38 
 
 		 621 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  49.28 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  26.67 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  30.99 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  30.61 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  37 
 
 		 176 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  40.82 
 
 		 264 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  33.52 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  34.72 
 
 		 179 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  37.5 
 
 		 199 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  27.42 
 
 		 171 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  36 
 
 		 170 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  36.67 
 
 		 199 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  41.43 
 
 		 180 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  36.67 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  36.67 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  37.38 
 
 		 166 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  34.07 
 
 		 205 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  30.81 
 
 		 181 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  33.96 
 
 		 439 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  36.7 
 
 		 181 aa  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  55.81 
 
 		 364 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  46.27 
 
 		 195 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  40.54 
 
 		 177 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  35.45 
 
 		 182 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  31.67 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>