139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2573 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  80.14 
 
 		 282 aa  447  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  39.8 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  37 
 
 		 268 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  45.08 
 
 		 483 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  37.44 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  36.73 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  33.5 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  38.61 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  43.97 
 
 		 654 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  43.97 
 
 		 654 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  62.9 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  46.3 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  32.82 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  46.67 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  45.92 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  43.33 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  36.36 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  44.79 
 
 		 157 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  32.99 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  41.51 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  41.18 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  41.58 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  41.58 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  43.14 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  39.23 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  38.68 
 
 		 174 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  40.57 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  28.64 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  41.27 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  40.52 
 
 		 172 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  45.36 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  53.45 
 
 		 170 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  40.59 
 
 		 199 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  40.59 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  36.52 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  32.18 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  40.59 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  37.04 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  36.63 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  39.6 
 
 		 177 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  40.2 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  33.51 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  50.88 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  51.72 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  53.97 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  40.59 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  38.83 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  31.19 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  36.8 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  32.19 
 
 		 165 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  35.92 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  39.29 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  31.41 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  38.94 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  41.76 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  29.44 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  35.14 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  58.14 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  30.95 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  31.77 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  33 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  35.51 
 
 		 175 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  31.61 
 
 		 169 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  34.26 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  30.89 
 
 		 180 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  53.57 
 
 		 82 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  48.39 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  34.91 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  47.37 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  34.91 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  35.96 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  35.61 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  33.88 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  35.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  48.21 
 
 		 80 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  45.9 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  35.85 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  45.61 
 
 		 166 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  30.98 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  34.26 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  33.08 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  34.29 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  33.64 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  46.55 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  30.61 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  37.37 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  32.46 
 
 		 735 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  56.52 
 
 		 169 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  55.1 
 
 		 181 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  30.94 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  49.06 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  49.06 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  49.06 
 
 		 414 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  35.78 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  39 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  36.36 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  47.46 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  36.28 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  33.67 
 
 		 169 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>