125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0519 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  100 
 
 
443 aa  882    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  30.43 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  39.42 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  42.86 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  42.86 
 
 
654 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  38.31 
 
 
180 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  35.27 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  33.52 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  47.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  28.37 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  47.25 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  64.15 
 
 
554 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
169 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  43.93 
 
 
300 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  42.39 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  32.69 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  45.16 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  28.43 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  33.96 
 
 
206 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  27.59 
 
 
165 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  40.45 
 
 
169 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  29.38 
 
 
182 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  27.27 
 
 
171 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  37.61 
 
 
196 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  41.86 
 
 
195 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  41.57 
 
 
199 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  41.49 
 
 
168 aa  63.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  36.11 
 
 
171 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  41.98 
 
 
170 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  27.59 
 
 
163 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  40.59 
 
 
195 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  31.11 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  43.68 
 
 
181 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  43.9 
 
 
173 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 
183 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  39.56 
 
 
326 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  28.78 
 
 
175 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  34.43 
 
 
176 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  39.81 
 
 
172 aa  60.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  41.11 
 
 
176 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  41.75 
 
 
326 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  36.73 
 
 
183 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  27.65 
 
 
224 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  28.3 
 
 
179 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  28.29 
 
 
183 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  37.08 
 
 
181 aa  60.1  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  40.24 
 
 
163 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  38.64 
 
 
171 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  30 
 
 
173 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  41.46 
 
 
177 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  38.89 
 
 
195 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  42.35 
 
 
166 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  37.4 
 
 
501 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  41.57 
 
 
173 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  41.76 
 
 
173 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  28.99 
 
 
180 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  35.56 
 
 
166 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.28 
 
 
492 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  39.76 
 
 
182 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  39.39 
 
 
414 aa  57.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  31.65 
 
 
179 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  31.54 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  36.26 
 
 
175 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  25.62 
 
 
170 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  42.5 
 
 
178 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  38.61 
 
 
817 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  34.34 
 
 
181 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  38.82 
 
 
192 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  39.39 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  40.43 
 
 
181 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  37.25 
 
 
186 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  36.78 
 
 
195 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  40.24 
 
 
172 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  39.08 
 
 
172 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  36.56 
 
 
210 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  40.48 
 
 
211 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  27.05 
 
 
167 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  41.46 
 
 
177 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  40 
 
 
207 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  28.71 
 
 
197 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  37.04 
 
 
179 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  38.27 
 
 
157 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  35.63 
 
 
174 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  38.37 
 
 
205 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  48.15 
 
 
204 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  34.38 
 
 
176 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2930  hypothetical protein  32.16 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
170 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  29.67 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  30 
 
 
176 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  28.3 
 
 
671 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  35.71 
 
 
199 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  35.87 
 
 
180 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  37.35 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  25.49 
 
 
173 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>