134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1348 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 
205 aa  424  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  48.07 
 
 
176 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  45.51 
 
 
170 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  44.2 
 
 
178 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  44.38 
 
 
173 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  44.13 
 
 
172 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  41.67 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  43.48 
 
 
181 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  42.78 
 
 
174 aa  144  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  43.02 
 
 
175 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  45.05 
 
 
173 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  44.75 
 
 
176 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  42.7 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  42.13 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  42.22 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  44.13 
 
 
171 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  42.55 
 
 
179 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  43.65 
 
 
169 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  41.11 
 
 
166 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  41.85 
 
 
180 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  45.56 
 
 
172 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  42.46 
 
 
163 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  42.31 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  45.3 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  40.68 
 
 
199 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  40.64 
 
 
182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  40.22 
 
 
170 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  40.56 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  42.22 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  40.31 
 
 
186 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  40 
 
 
175 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  40.72 
 
 
189 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  39.44 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  40.72 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  39.23 
 
 
172 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  43.08 
 
 
192 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  39.59 
 
 
198 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  37.69 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  37.19 
 
 
199 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  42.78 
 
 
173 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  42.39 
 
 
181 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  38.5 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  45.56 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  41.36 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  39.11 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  43.58 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  36.68 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  39.44 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  38.71 
 
 
187 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  39.13 
 
 
183 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  38.92 
 
 
179 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  41.76 
 
 
157 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  41.76 
 
 
173 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  38.04 
 
 
176 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  40.24 
 
 
163 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  38.71 
 
 
165 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  37.84 
 
 
181 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  41.21 
 
 
167 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  37.57 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  38.74 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  37.16 
 
 
180 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  36.17 
 
 
179 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  39.33 
 
 
180 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  54.64 
 
 
195 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  40 
 
 
176 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  37.23 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  38.04 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  40.56 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  35.71 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  33.85 
 
 
195 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  35.05 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  35.9 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  38.71 
 
 
166 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  38.83 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  39.89 
 
 
172 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  34.27 
 
 
173 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  34.83 
 
 
199 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  35.64 
 
 
181 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  35.29 
 
 
184 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  36.97 
 
 
211 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  35.2 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  49 
 
 
206 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  35.14 
 
 
224 aa  98.2  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  36.67 
 
 
165 aa  98.2  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  33.68 
 
 
181 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  31.02 
 
 
264 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  30.29 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  34.12 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  42.86 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  41.12 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  43.9 
 
 
310 aa  82  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  33.7 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  53.85 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  51.61 
 
 
80 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  57.14 
 
 
84 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  36.41 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  50.82 
 
 
80 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  50.75 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  42.74 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  39.25 
 
 
304 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>