143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4880 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  100 
 
 
181 aa  359  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  60.66 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  60.44 
 
 
176 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  56.38 
 
 
178 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  55.5 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  55 
 
 
199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  55 
 
 
199 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  55.5 
 
 
199 aa  197  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  55.33 
 
 
196 aa  197  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  53.59 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  50 
 
 
174 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  54.95 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  51.93 
 
 
175 aa  180  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  50.81 
 
 
179 aa  180  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  51.91 
 
 
176 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  51.37 
 
 
179 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  52.72 
 
 
183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  50 
 
 
171 aa  178  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  47.54 
 
 
179 aa  177  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  52.72 
 
 
181 aa  177  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  49.72 
 
 
169 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 
171 aa  175  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  50.28 
 
 
169 aa  174  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  46.96 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  51.93 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  51.09 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  50.56 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  47.51 
 
 
175 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  47.75 
 
 
170 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  51.67 
 
 
172 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  49.48 
 
 
195 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  48.62 
 
 
173 aa  168  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  49.48 
 
 
189 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  49.48 
 
 
189 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  47.34 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  47.51 
 
 
166 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  47.06 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  50.28 
 
 
163 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  49.47 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 
170 aa  160  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  46.11 
 
 
171 aa  160  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  49.44 
 
 
165 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  48.62 
 
 
195 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  47.65 
 
 
163 aa  157  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  51.1 
 
 
173 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  45.56 
 
 
172 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  45.3 
 
 
169 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  46.94 
 
 
195 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  45.3 
 
 
180 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  44.39 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  50 
 
 
166 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  45.55 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  47.98 
 
 
198 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  48.11 
 
 
176 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  43.96 
 
 
180 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  43.58 
 
 
199 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  49.72 
 
 
167 aa  149  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  47.34 
 
 
157 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  47.18 
 
 
192 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  45.31 
 
 
182 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  48.62 
 
 
165 aa  147  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  47.49 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  47.78 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  43.41 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  43.48 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  41.99 
 
 
177 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  44.09 
 
 
187 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  44.68 
 
 
186 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  44.51 
 
 
173 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  44.06 
 
 
195 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  47.78 
 
 
175 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  49.72 
 
 
172 aa  141  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  44.39 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  42.31 
 
 
181 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  42.46 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  41.67 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  46.11 
 
 
173 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  43.17 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  39.8 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  49.72 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  48.11 
 
 
179 aa  131  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  41.71 
 
 
211 aa  129  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  40.85 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  42.86 
 
 
184 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  47.87 
 
 
179 aa  121  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  40.59 
 
 
207 aa  121  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  37.2 
 
 
209 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  36.54 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  36.19 
 
 
210 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  39.88 
 
 
264 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  36.41 
 
 
204 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  69.84 
 
 
80 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  68.85 
 
 
80 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  41.12 
 
 
246 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  67.86 
 
 
84 aa  84.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  46.94 
 
 
270 aa  84.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  62.9 
 
 
80 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  58.62 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>