93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01348 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  999    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  46.56 
 
 		 323 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  46.56 
 
 		 530 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  46.56 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  46.56 
 
 		 530 aa  217  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  53.54 
 
 		 656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  45.91 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  32.02 
 
 		 536 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  45.1 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  45.1 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0190  hypothetical protein  48.24 
 
 		 569 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  46.47 
 
 		 790 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  42.39 
 
 		 616 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  34.29 
 
 		 414 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  31.41 
 
 		 735 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  33.92 
 
 		 654 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  33.92 
 
 		 654 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  28.35 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  40.98 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  37.61 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  27.27 
 
 		 962 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  36.84 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  56.6 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  30.41 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  58.14 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  29.11 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  58.14 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  35.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  35.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  35.92 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  58.14 
 
 		 282 aa  57  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  35.71 
 
 		 199 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  24.71 
 
 		 170 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  29.29 
 
 		 167 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  42.03 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  34.65 
 
 		 181 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  36.99 
 
 		 80 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  27.12 
 
 		 172 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  29.02 
 
 		 199 aa  50.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  40.74 
 
 		 180 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 182 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  46.3 
 
 		 80 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  42.59 
 
 		 177 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  36 
 
 		 181 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  28.77 
 
 		 228 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  42.59 
 
 		 80 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  32.81 
 
 		 192 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  34.83 
 
 		 176 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  40.74 
 
 		 176 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  38.16 
 
 		 1120 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  32.14 
 
 		 195 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  38.6 
 
 		 211 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  24.64 
 
 		 1007 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  38.89 
 
 		 174 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  32.46 
 
 		 178 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  33.72 
 
 		 157 aa  47  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0486  Tail Collar domain protein  39.29 
 
 		 87 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  31.39 
 
 		 516 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  26.67 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  38.98 
 
 		 181 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  34.04 
 
 		 178 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 		 195 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  34.75 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  40 
 
 		 203 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  40.98 
 
 		 199 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  37.74 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  42.59 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  33 
 
 		 172 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  27.54 
 
 		 163 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  26.28 
 
 		 166 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  29.84 
 
 		 304 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  28.21 
 
 		 171 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  41.51 
 
 		 180 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  32.65 
 
 		 281 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  22.89 
 
 		 166 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  32.81 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  37.74 
 
 		 80 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  42.59 
 
 		 173 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  30.26 
 
 		 206 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  35.59 
 
 		 169 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  30.53 
 
 		 181 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  33.71 
 
 		 173 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  28.95 
 
 		 170 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  35.19 
 
 		 173 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  40 
 
 		 1137 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  30.09 
 
 		 178 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  38.89 
 
 		 195 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  31.31 
 
 		 171 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  30.85 
 
 		 224 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>