27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1209 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  60.91 
 
 		 292 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01992  hypothetical protein  32.94 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2898  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0582  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  37.58 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770927  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  31.75 
 
 		 616 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4133  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  35.26 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.586473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  31.67 
 
 		 790 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1308  hypothetical protein  28.26 
 
 		 443 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  33.93 
 
 		 656 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  31.62 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  30.88 
 
 		 530 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  30.83 
 
 		 536 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.25 
 
 		 697 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  31.15 
 
 		 530 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  31.15 
 
 		 530 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.07 
 
 		 473 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  28.04 
 
 		 399 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  28.03 
 
 		 501 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  31.07 
 
 		 540 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  32.04 
 
 		 401 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  31.07 
 
 		 540 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  31.07 
 
 		 479 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  31.07 
 
 		 498 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  31.07 
 
 		 660 aa  42.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  30.1 
 
 		 583 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  29.57 
 
 		 689 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>