17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3056 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  60.91 
 
 		 228 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01992  hypothetical protein  32.75 
 
 		 177 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2898  hypothetical protein  34.84 
 
 		 176 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0582  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  35.14 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.770927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4133  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  33.11 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.586473 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  34.4 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  34.09 
 
 		 656 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  36.44 
 
 		 660 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1308  hypothetical protein  30.56 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  33.04 
 
 		 479 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  34.26 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  33.91 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  33.04 
 
 		 697 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.9 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  31.9 
 
 		 646 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  28.7 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>