58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4853 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1080    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  58.52 
 
 
790 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  54.38 
 
 
735 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0190  hypothetical protein  62.86 
 
 
569 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0889  hypothetical protein  49.43 
 
 
656 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  45.98 
 
 
616 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  45.81 
 
 
501 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0398  hypothetical protein  48.28 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.738816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1137  hypothetical protein  48.28 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.757032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0356  hypothetical protein  47.7 
 
 
323 aa  148  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1159  hypothetical protein  47.7 
 
 
530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  46.03 
 
 
387 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  32.62 
 
 
483 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  35.04 
 
 
654 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  35.04 
 
 
654 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  46.67 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  39.62 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  44.76 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  41.96 
 
 
817 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  28.74 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  29.03 
 
 
414 aa  70.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  28.74 
 
 
387 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  39.25 
 
 
225 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  43.12 
 
 
505 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  26.34 
 
 
323 aa  61.2  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  33.64 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.27 
 
 
492 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  34.4 
 
 
485 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  33.08 
 
 
557 aa  57.4  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  31.54 
 
 
646 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  31.4 
 
 
177 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  31.4 
 
 
176 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  34.13 
 
 
689 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  22.13 
 
 
180 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  31.19 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  22.13 
 
 
179 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  34.95 
 
 
530 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  28.67 
 
 
682 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  30.3 
 
 
472 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  37.35 
 
 
264 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  35.23 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  26.43 
 
 
580 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  37.93 
 
 
340 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  35.63 
 
 
259 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  35.63 
 
 
259 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  35.23 
 
 
401 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  34.48 
 
 
371 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  32.95 
 
 
183 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3328  hypothetical protein  54.17 
 
 
568 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  33.96 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  30.83 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  34.48 
 
 
166 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  24.8 
 
 
281 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  29.05 
 
 
536 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  34.29 
 
 
441 aa  45.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  28.63 
 
 
1137 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  28.46 
 
 
414 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  41.33 
 
 
962 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>