12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4585 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  890    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  54.55 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  46.67 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  47.92 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  44.14 
 
 		 790 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  47.56 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  34.71 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  42.86 
 
 		 554 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  43.18 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  37.04 
 
 		 654 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  37.04 
 
 		 654 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  36.08 
 
 		 817 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>