22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3092 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  958    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2372  hypothetical protein  93.33 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.33 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.33 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  31.3 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  48.24 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  48.24 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  30.72 
 
 		 962 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  31.18 
 
 		 646 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  34.02 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  27.12 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  30.56 
 
 		 259 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  33.33 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 166 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  30.3 
 
 		 536 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  35.48 
 
 		 621 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  30.54 
 
 		 735 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  33.07 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  42.35 
 
 		 140 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  40.48 
 
 		 140 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  34.51 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>