49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0635 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  76.6 
 
 		 140 aa  224  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  68.28 
 
 		 532 aa  186  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  68.28 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  52.98 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  44.67 
 
 		 259 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  44.67 
 
 		 259 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  45 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  44.52 
 
 		 621 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  46.32 
 
 		 689 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 682 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  40.28 
 
 		 646 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  37.16 
 
 		 340 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  34.21 
 
 		 180 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  34.21 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  35.42 
 
 		 196 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  37.76 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  34.25 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  34.87 
 
 		 262 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  30.22 
 
 		 371 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  30.22 
 
 		 485 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  46.27 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  30.67 
 
 		 401 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  34.03 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  46.27 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  31.9 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  48.44 
 
 		 557 aa  66.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  26.28 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  33.06 
 
 		 519 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  37.68 
 
 		 962 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  39.29 
 
 		 527 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  35.53 
 
 		 1007 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  27.49 
 
 		 817 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  44.44 
 
 		 264 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  36.49 
 
 		 516 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  35.62 
 
 		 1120 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  35.62 
 
 		 536 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  35.62 
 
 		 441 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  35.62 
 
 		 1137 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  35.62 
 
 		 320 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  40.48 
 
 		 472 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  40 
 
 		 790 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  33.77 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  40 
 
 		 805 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  34.25 
 
 		 281 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  40 
 
 		 569 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  33.94 
 
 		 439 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  35.38 
 
 		 442 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  40 
 
 		 463 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>