53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0638 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  100 
 
 		 532 aa  320  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  68.28 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  68.57 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  56.46 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  46.47 
 
 		 689 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  47.92 
 
 		 621 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  46.54 
 
 		 259 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  46.54 
 
 		 259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  48.92 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  43.75 
 
 		 646 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  42.57 
 
 		 682 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  40.28 
 
 		 340 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  38.85 
 
 		 530 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  36.62 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  35.76 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  30.67 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  30.67 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  42.39 
 
 		 498 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  30.67 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  32.86 
 
 		 485 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  36.43 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  42.86 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  50.79 
 
 		 557 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  49.21 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  31.03 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  39.64 
 
 		 527 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  48.24 
 
 		 472 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  26.59 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  39.13 
 
 		 962 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  27.44 
 
 		 323 aa  52.4  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  27.47 
 
 		 817 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  34.26 
 
 		 1007 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  35.09 
 
 		 519 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  37.84 
 
 		 516 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  29.1 
 
 		 264 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  37.84 
 
 		 536 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  34.91 
 
 		 492 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  37.84 
 
 		 1137 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  37.84 
 
 		 1120 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  37.84 
 
 		 441 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  37.84 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  30.91 
 
 		 442 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  32.56 
 
 		 483 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  31.03 
 
 		 554 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  36.62 
 
 		 805 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  30.63 
 
 		 580 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  36.62 
 
 		 790 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  36.62 
 
 		 569 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  36.62 
 
 		 463 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  38.89 
 
 		 791 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>