69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1427 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  90.02 
 
 		 790 aa  1120    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  96.54 
 
 		 463 aa  932    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  100 
 
 		 805 aa  1598    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  95.51 
 
 		 569 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  89.3 
 
 		 791 aa  1110    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  84.68 
 
 		 442 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  89.52 
 
 		 892 aa  562  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  45.45 
 
 		 962 aa  422  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  44.48 
 
 		 1007 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  58.13 
 
 		 320 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  57.04 
 
 		 281 aa  292  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  73.3 
 
 		 580 aa  290  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  80.4 
 
 		 280 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  60.1 
 
 		 401 aa  279  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  60.1 
 
 		 401 aa  279  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  57.72 
 
 		 1120 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  55.51 
 
 		 1137 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  59.5 
 
 		 411 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  55.13 
 
 		 441 aa  243  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  57.89 
 
 		 516 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  58.33 
 
 		 1258 aa  231  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  59.5 
 
 		 437 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  55.27 
 
 		 438 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  55.23 
 
 		 451 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  59.09 
 
 		 845 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  54.81 
 
 		 407 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  56.07 
 
 		 437 aa  213  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.81 
 
 		 434 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  55.23 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  54.81 
 
 		 437 aa  207  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  82.73 
 
 		 198 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  51.09 
 
 		 673 aa  152  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  43.77 
 
 		 570 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  60.53 
 
 		 473 aa  127  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  61.61 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  61.61 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  58.56 
 
 		 588 aa  114  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  52.08 
 
 		 399 aa  94.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  44.96 
 
 		 621 aa  94.7  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  41.1 
 
 		 561 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  43.45 
 
 		 689 aa  92  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  37.06 
 
 		 468 aa  77.4  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.97 
 
 		 697 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  58.33 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  37.38 
 
 		 682 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  49.25 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  49.28 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  31.12 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  30.77 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  35.9 
 
 		 259 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  38.32 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  52.94 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  35.34 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  47.76 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  29.67 
 
 		 166 aa  63.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  42.53 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  52 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  73.68 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  25.73 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  30 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  47.42 
 
 		 522 aa  60.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  80 
 
 		 536 aa  55.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  47.89 
 
 		 552 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  34.55 
 
 		 385 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  28.52 
 
 		 762 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  62.79 
 
 		 583 aa  45.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  32.11 
 
 		 2906 aa  44.7  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>