107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2015 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  100 
 
 		 442 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  85.71 
 
 		 463 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  85.18 
 
 		 805 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  73.05 
 
 		 790 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  72.58 
 
 		 791 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  80.23 
 
 		 569 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  50.39 
 
 		 962 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  59.83 
 
 		 1007 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  65.93 
 
 		 320 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  87.83 
 
 		 192 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  75.18 
 
 		 892 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  94.78 
 
 		 293 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  58.01 
 
 		 280 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  68.28 
 
 		 281 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  76.11 
 
 		 193 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  76.11 
 
 		 193 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  76.79 
 
 		 189 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  82.14 
 
 		 193 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  68.85 
 
 		 1120 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  68.85 
 
 		 1137 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  70.54 
 
 		 189 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  68.85 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  67.5 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  68.93 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  66.34 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  67.96 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  56.9 
 
 		 194 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  64.08 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  64.08 
 
 		 540 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  60.4 
 
 		 191 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  60.4 
 
 		 191 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  59.41 
 
 		 191 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  59.41 
 
 		 247 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  58.42 
 
 		 194 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  58.42 
 
 		 194 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  94.87 
 
 		 78 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  58.42 
 
 		 191 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  58.42 
 
 		 193 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  58.42 
 
 		 194 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  59.8 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  57.43 
 
 		 138 aa  117  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  54.72 
 
 		 202 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  43.37 
 
 		 673 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  46.51 
 
 		 621 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  45.32 
 
 		 570 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  46.85 
 
 		 190 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  44.83 
 
 		 689 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  51.04 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  49.02 
 
 		 561 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  61.11 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  40.44 
 
 		 697 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  37.67 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  32.93 
 
 		 188 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  54.24 
 
 		 171 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  34.86 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  51.56 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  54.67 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  41.77 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  76.32 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  55 
 
 		 89 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  37.38 
 
 		 682 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  32.71 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  42.11 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  46.27 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  54.84 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  34.19 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  54.1 
 
 		 88 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  44.93 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  41.03 
 
 		 179 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  39.81 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  60.42 
 
 		 89 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  54.84 
 
 		 184 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  53.97 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  65.12 
 
 		 82 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  41.03 
 
 		 180 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  48.39 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  53.12 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  41.18 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  31.85 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  53.23 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  29.91 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  49.02 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  32.76 
 
 		 204 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  44.78 
 
 		 557 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  56.45 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  37.18 
 
 		 262 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  35.42 
 
 		 177 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  60.47 
 
 		 514 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  60.47 
 
 		 520 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  46 
 
 		 646 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  39.73 
 
 		 144 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  34.38 
 
 		 176 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  50.85 
 
 		 92 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  48.33 
 
 		 175 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  34.83 
 
 		 183 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 		 196 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  34.29 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  39.51 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>