44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1693 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  33.5 
 
 		 253 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  32.66 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  32.49 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  36.72 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  35.94 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  27.32 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  30.96 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  34 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  35.48 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  31 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  31.14 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  31.14 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  31.14 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  31.14 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  30.54 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  32.17 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  28.93 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  26.53 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  30.54 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  30.54 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  31.54 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  29.34 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  31.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  32.86 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  31.29 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  27.78 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  27.78 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  25.45 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  33.83 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  35.29 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  39.81 
 
 		 442 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  28.57 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  30 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  38.71 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  44.78 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  26.73 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  30.37 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  44.78 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  48.15 
 
 		 78 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  48 
 
 		 89 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0560  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  26.53 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  41.54 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  43.4 
 
 		 170 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>