66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4536 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  46.47 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  34.86 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  33.71 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  36.76 
 
 		 184 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  31.64 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  31.11 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  32.89 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  34.36 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  34 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  47.19 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  45.56 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  47.73 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  46.07 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  46.07 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  30.51 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 247 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  48.72 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  44.32 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  50.72 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  47.25 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  47.25 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  29.22 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  44.32 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  43.18 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  45.45 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  26.97 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  62.26 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  55.93 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  54.24 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  26.4 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  26.4 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  60.78 
 
 		 88 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  60.78 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  27.91 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  34.56 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  40.23 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  26.95 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  52.54 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  50.85 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  45.95 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  38.89 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  36.47 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  38.81 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  25.97 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  65 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  45.9 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  42.37 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  43.55 
 
 		 209 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  34.18 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  39.13 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  42.19 
 
 		 92 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  38.71 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  58.33 
 
 		 36 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  41.18 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  50 
 
 		 47 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  31.87 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  28.57 
 
 		 131 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  32.43 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  30.56 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  60.71 
 
 		 30 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>